O programa de Pós-Graduação em Computação da UFC, sediado no campus de Quixadá, foi aprovado pela CAPES em Outubro de 2018 e teve suas atividades iniciadas em 18 de Fevereiro de 2019. O programa conta com três linhas de pesquisa: Algoritmos e Teoria da Computação, Engenharia de Software e Metodologias e Sistemas de Computação. A seleção é anual e são 21 vagas.
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